“东京决战”一年后，布里塔尼亚少年鲁路修在11区（原日本国）过着伟大的先生生活。但是，鲁路修与弟弟罗洛的一次出行，遇到了黑色骑士团的余党。在与少女C.C再次结成契约之后，尘封的记忆摆在了鲁路修的面前。 
　　身为帝国王子的鲁路修，为了树立人人对等的世界、让妹妹娜娜丽幸福的世界，而运用GEASS，令人相对听从的力气，率领黑色骑士团向帝国宣战。带上假面化名ZERO的他，却在一年前的“东京决战”中被好友朱雀击败，被帝国皇帝抹去了记忆。 
　　如今，恢复记忆的鲁路修不只要面对帝国的弱小军事力气，更要面对虚伪的弟弟罗洛、失踪的妹妹娜娜丽、不知敌友的中华联、外部出现分歧的黑色骑士团。面对内忧内乱，鲁路修走上了GEASS之力的诅咒——孤独的王之路。